Pembangun genom?

• April 19, 2024

Enam belas tahun yang lalu dunia bertemu mamalia hasil kloning pertama: Dolly the sheep. Di luar keheranan atau ketakutan yang disebabkan pada saat itu, memperoleh informasi dalam biologi molekuler Ini telah dipercepat pada tingkat yang mengesankan karena pengembangan teknologi baru, lebih efisien, lebih cepat dan lebih mudah diakses.

Hal ini menimbulkan kelemahan: bagaimana menganalisis dan memahami semua dunia data dan informasi untuk mendeteksi dan memecahkan masalah biologis? Dalam era booming bangunan genom, para peneliti menggabungkan kemajuan dalam ilmu genom dan mesin komputer untuk membuat basis data informasi biologis dalam sebuah buku elektronik.

Spesialis genomik komputasi Pusat Ilmu Genomik UNAM membimbing ilmuwan lain ke kedalaman sifat suatu organisme. Misinya adalah untuk membantu para peneliti dalam studi gen dan genom, selain memodelkan dan memprediksi konsep biologi, seperti perilaku sel.

Salah satu pencapaian terbesar tim, dipimpin oleh dokter Julio Collado Vides , adalah untuk mendapatkan urutan lengkap dari genom bakteri Escherichia colli, kontribusi yang diterbitkan pada tahun 1997 dalam jurnal Sains , salah satu yang paling dikenal di dunia ilmiah. Hingga saat ini, proyek utama kelompok ini adalah edisi buku elektronik fisiologi bakteri ini dan lainnya.

Genomik adalah studi tentang totalitas sifat-sifat genom: struktur, interaksi dan fungsi komponen-komponennya. Genom adalah bahan genetik dari suatu organisme, dan berisi semua informasi yang diperlukan untuk penciptaan dan pengembangan makhluk itu dan transfer karakteristiknya dari generasi ke generasi.

Pengetahuan yang berasal dari ilmu genom tumbuh dari hari ke hari. Hanya sekitar 500 artikel ilmiah per tahun yang dihasilkan di sekitar Escherichia colli. "Ini adalah organisme paling terkenal di tingkat molekuler. Dari situlah lahir biologi molekuler, "kata ilmuwan universitas.

Kelompok genomik komputasi meninjau dan menyimpan data yang ditangkap dalam literatur ilmiah, yang kemudian akan ditafsirkan oleh peneliti lain.

"Kami adalah kurator, kami membaca artikel dan mengekstraksi bukti dan penemuan, mengkodekan semua informasi itu dalam struktur komputasi yang memungkinkan kami mewakili potongan-potongan sel dan interaksinya", sorot Julio Collado.

Ilmuwan lain bertanggung jawab untuk memahami arti dari data ini dan menarik kesimpulan, seperti menjelaskan mengapa manusia dan lalat sangat berbeda jika genomnya bertepatan 60%; atau mengapa beberapa anggota keluarga mengembangkan jenis kanker tertentu.

Menghadapi panorama ini, Collado Vides bertanya-tanya apa nasib bakteri Escherichia colli, sebagai bagian dari pengetahuan biologis yang dapat berkontribusi pada genomik masa depan. "Kami tahu banyak tentang satu organisme tunggal sehingga tantangannya adalah mengintegrasikan semua pengetahuan yang dihasilkan para ilmuwan untuk mewakili kompleksitas biologis."

Dengan infrastruktur tingkat pertama dari Computational Genomics Group, para anggotanya mengembangkan metode untuk memprediksi jaringan regulasi, faktor transkripsi dan asosiasi fungsional antar gen.

Sains berkontribusi untuk meningkatkan kualitas hidup kita, berpartisipasi dalam Agenda Warga Teknologi Sains dan Inovasi, konsultasi nasional di mana Anda dapat memilih tantangan yang Anda anggap harus menghadapi sains dan teknologi untuk mencapai kualitas hidup yang lebih baik di tahun 2030 Anda dapat memilih tantangan yang tampaknya paling penting bagi Anda: www.agendaciudadana.mx

Ikuti kami di @GetQoralHealth, GetQoralHealth di Facebook dan YouTube